Harju-Madise koguduse esmamainimise aastaks võib lugeda aastat 1296, mil Vasalemma jõe suudmealal mainitakse Lodenrodhet kui kindlustatud linna ja paika. Kindlasti ei puudunud seal kirikki.

Jüriöö ülestõusu järel ehitati peagi uus puukirik, kuni 15.saj keskel rajati praegusele kohale juba kivikirik.

Ainsana Eestis põleb Harju-Madise kiriku tornis majakatuli.

Täna on Harju-Madise kirik teiseks koduks rohkem kui 500-le ristiinimesele Padise, Vasalemma ja Keila vallast, Keila linnast, Tallinnast ja kaugemaltki.