Viru-Jaagupi (Viru-Jaakobi) kiriku täpne ehitusaeg on teadmata, selle esmamainimine pärineb 1473. aastast.
Kiriku hävitasid 16. sajandi lõpul sõjas vene väed ning see ehitati taas üles 1669. aastal. 1703. aastal Põhjasõjas laastati kirikumõis taas. Kiriku süütasid Vene väed 1703. ja 1708. aastal.
Kirik taastati ja uuendati 1877. ja 1878. aastal.